Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms