Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc5P35689 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc5P35689 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc5P35689 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc5P35689 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc5P35689 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc5P35689 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc5P35689 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc5P35689 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc5P35689 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc5P35689 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc5P35689 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc5P35689 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc5P35689 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc5P35689 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc5P35689 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc5P35689 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms