Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddit3P35639 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms