Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp3P28862 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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