Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RxrbP28704 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrbP28704 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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