Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NdnP25233 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NdnP25233 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NdnP25233 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NdnP25233 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NdnP25233 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NdnP25233 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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NdnP25233 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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NdnP25233 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NdnP25233 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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