Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PrkchP23298 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkchP23298 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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