Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Eif3aP23116 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms