Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms