Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NefhP19246 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NefhP19246 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NefhP19246 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms