Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sdc1P18828 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms