Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18528 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18528 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18528 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms