Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Hoxb1P17919 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Hoxb1P17919 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Hoxb1P17919 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Hoxb1P17919 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Hoxb1P17919 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Hoxb1P17919 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Hoxb1P17919 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Hoxb1P17919 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Hoxb1P17919 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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