Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms