Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms