Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms