Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms