Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb7P09024 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb7P09024 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms