Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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TtrP07309 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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TtrP07309 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
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TtrP07309 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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TtrP07309 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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TtrP07309 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TtrP07309 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TtrP07309 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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TtrP07309 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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TtrP07309 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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