Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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PdgfrbP05622 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PdgfrbP05622 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PdgfrbP05622 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PdgfrbP05622 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PdgfrbP05622 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PdgfrbP05622 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PdgfrbP05622 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PdgfrbP05622 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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