Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms