Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01853 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01853 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01853 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01853 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01853 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01853 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01853 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01853 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01853 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01853 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01853 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01853 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01853 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01853 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01853 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01853 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01853 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01853 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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