Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClppO88696 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClppO88696 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClppO88696 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClppO88696 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClppO88696 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClppO88696 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClppO88696 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClppO88696 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClppO88696 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClppO88696 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClppO88696 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClppO88696 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms