Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms