Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TsksO54887 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TsksO54887 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TsksO54887 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TsksO54887 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TsksO54887 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TsksO54887 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TsksO54887 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TsksO54887 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TsksO54887 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TsksO54887 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TsksO54887 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TsksO54887 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TsksO54887 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TsksO54887 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TsksO54887 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TsksO54887 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TsksO54887 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TsksO54887 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TsksO54887 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TsksO54887 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TsksO54887 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TsksO54887 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TsksO54887 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TsksO54887 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms