Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DffaO54786 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DffaO54786 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DffaO54786 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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DffaO54786 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DffaO54786 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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DffaO54786 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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DffaO54786 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DffaO54786 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DffaO54786 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DffaO54786 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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DffaO54786 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DffaO54786 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DffaO54786 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DffaO54786 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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DffaO54786 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DffaO54786 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DffaO54786 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DffaO54786 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DffaO54786 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DffaO54786 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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DffaO54786 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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DffaO54786 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DffaO54786 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DffaO54786 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DffaO54786 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DffaO54786 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DffaO54786 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DffaO54786 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DffaO54786 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DffaO54786 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DffaO54786 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DffaO54786 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DffaO54786 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DffaO54786 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DffaO54786 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DffaO54786 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DffaO54786 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DffaO54786 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DffaO54786 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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