Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Nek2O35942 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nek2O35942 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms