Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms