Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lhx8O35652 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms