Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Prrt1O35449 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Prrt1O35449 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Prrt1O35449 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Prrt1O35449 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Prrt1O35449 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Prrt1O35449 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Prrt1O35449 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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Prrt1O35449 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt1O35449 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt1O35449 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt1O35449 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt1O35449 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt1O35449 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt1O35449 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt1O35449 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt1O35449 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt1O35449 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt1O35449 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt1O35449 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt1O35449 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt1O35449 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt1O35449 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt1O35449 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt1O35449 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt1O35449 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt1O35449 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Prrt1O35449 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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