Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KeraO35367 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
KeraO35367 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KeraO35367 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KeraO35367 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KeraO35367 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KeraO35367 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KeraO35367 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KeraO35367 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms