Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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