Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms