Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EllO08856 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EllO08856 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
EllO08856 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
EllO08856 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
EllO08856 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms