Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltaO08585 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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CltaO08585 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltaO08585 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltaO08585 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltaO08585 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltaO08585 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltaO08585 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltaO08585 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltaO08585 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltaO08585 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms