Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms