Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm3278L7N2D2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm3278L7N2D2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm3278L7N2D2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm3278L7N2D2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Gm3278L7N2D2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm3278L7N2D2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm3278L7N2D2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms