Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Ttll1-203ENSMUST00000109480 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm32284-201ENSMUST00000213704 1484 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Tmem106a-202ENSMUST00000100403 2428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 5330411J11Rik-201ENSMUST00000137162 1635 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Tex24-201ENSMUST00000095375 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Olfr155-201ENSMUST00000095108 1172 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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