Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms