Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21900J3QP38 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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