Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc180J3QNE4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms