Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms