Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm3727J3QM54 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm3727J3QM54 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm3727J3QM54 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3727J3QM54 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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