Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pot1bH7BX60 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms