Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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