Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp17ldG5E8G2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms