Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r34G3XA52 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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