Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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