Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crocc2F6XLV1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Crocc2F6XLV1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms