Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6619F6URP1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms